Die Umsetzung des pädagogischen Konzeptes erfolgt durch die jeweiligen Einrichtungsleitungen vor Ort. Darüber hinaus findet regelmäßig ein einrichtungsübergreifender Austausch zur Weiterentwicklung der pädagogischen Arbeit der Einrichtungen statt. Alle Teams werden durch Supervision begleitet und reflektieren ihre fachliche Arbeit dadurch kontinuierlich.

Die Geschäftsführung der Inneren Mission Kinder- und Jugendhilfe gGmbH obliegt dem Vorstand der Inneren Mission.